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浅析sklearn中的数据预处理方法

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+ Y! t* N$ _* Q) m; U8 ~/ A% b

简介

4 D* q1 h- ^* H: m2 ]/ Z3 j6 m

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

9 T- c0 G# g% }; `

数据集准备

. s& w E6 O9 w( B

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

' E+ f) i. i; l+ ]. j& D
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集6 c+ ~* S y" L. s6 D/ B8 t import numpy as np& ]8 F: o( z+ Y4 @; l8 H & v$ X P# \$ s5 H$ d& r$ F4 ` iris = load_iris() # 特征矩阵 / F! P; A- M2 M: m/ t& a print(iris.data.shape) # (150, 4)# Z3 U7 [3 |& m0 M3 L& i print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]] " o4 O% F6 [; m) \/ E9 y print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2] 8 k, h0 O7 a& n) O, ]% ?
/ ~) K/ E1 |, X$ O4 c. l; X+ s

无量纲化

1 ^7 B# C; U6 C2 _1 M

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

0 @1 C" \' h2 D H5 l6 N$ q! k

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

: _7 k0 j" c7 z; E" z+ A* }

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

9 |( ]: A) z6 u/ z% |0 c

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

, f' n0 d, ^4 o h* l! x0 \

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

' _* u" j2 \/ [9 I6 D9 \( N

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

+ F# G; a% [( G3 w. Q3 a

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

) q1 j1 U# G5 u6 E& a: v! J

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

4 W3 B0 N8 o% [! o7 q" ^. l

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

/ Y K4 q" m; q+ S/ U

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

$ E4 _8 j5 u4 j4 R3 q

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

5 {% n' E" w! O! Y% I

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

+ U1 a4 e' y5 O+ C
from sklearn.preprocessing import StandardScaler5 f; a8 Q9 T. d4 u8 ~* v: i6 T" F 2 I6 A+ F, v. q' `6 `# P # 标准化,返回值为标准化后的数据 7 }" k' z9 ]# g: b& M0 f4 q standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data)5 ]' D0 A! @7 C" I print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]]' @% w( f( e8 |! X
8 T% H: ]7 }3 D6 j/ l

归一化-区间缩放法

: ?+ y& e; j- ]

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

0 }- s" ^, [* ^0 O& J% n" M* l

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

) V) U# M, W, s6 T' p

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

% p# L. V, F. \# f

常见用于神经网络。

& V: v" q8 `( o# w7 O# [( h. b4 H

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

- d6 g8 s( X5 r# P4 d2 n
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据2 N4 p: v8 V3 Z$ T) u* h' K" w from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler $ \% b+ @7 x) w# e3 J. Y) y% j) a" @0 ] min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data) 0 S7 W3 i' s5 m) r2 H print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]]0 g; J" Q1 u) I# {5 Q5 z
9 @, L8 J2 r% z+ j( W% @

正则化(Normalization)

p4 B0 z/ ~+ w( d8 q

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

, P. \* C$ V' H

常见用于文本分类和聚类。

3 S. B+ G6 P( V, H6 E8 v

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

8 F' a5 }; d/ U$ j0 D0 b

LpL_p范数的计算公式如下所示:

/ g# S3 |* @1 v' @% X' M+ [# f! |

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

( D5 F) g& x3 ~& \+ r0 M

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

( Y. a6 G5 {' j7 o7 ~

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

$ S, R2 o6 U6 T* Q; {; a. G

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

& ^$ ?+ P* t- t' w( [! P- b6 e

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

, ~! ?5 t& K3 s X& }8 r# a
from sklearn.preprocessing import Normalizer 2 R6 [ e3 a; Z' c5 O' b1 H% v # m0 }; J z# `. z2 L norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data) # a4 q; p+ O8 G print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667] N9 y. p, A0 s0 G# X
9 d8 i7 M* b" a

参数说明:

& \/ M% S5 H3 t) U0 C9 K' s/ l% [

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

& E$ u b- L2 Y7 P4 k6 z

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

, i+ \, U, G; `

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

) C$ v, a y+ V7 }8 R6 {- n; [

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

2 |( c' q! V0 {6 k. w+ |8 C

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

" x; n9 [# T# y- d
from sklearn.preprocessing import Binarizer! E- ?% r B4 W* X! ]9 T . Q0 x' |! O4 S# i7 a" l # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据5 x5 Z- Y. R4 ^& x5 E6 i binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data) 6 ?; d. U! t! n; ?, M, M print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]]! C* N0 `8 q& w9 Y" U3 g9 g
3 w$ M; z$ k1 N2 r/ }- t) o' Q

对定性特征独热编码

$ _* E7 q5 ~- V3 l

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

" u3 u9 R: E' l8 o' b: G/ p

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

. E7 n, h# u' e: L5 G. Y5 b9 B9 c

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

' G$ A/ h% Y; v; k" z8 @
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据 $ p0 K' ?* W- n: ^8 @' E0 B from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder* ?2 q* M* t6 G' z import pandas as pd7 a8 U. }: a; ~# }, M7 { P ; J2 N) _' d/ Z( }/ D3 `0 b print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1) ; L- z8 I+ a# Z2 d2 H one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1)) 3 O) a' L$ ~ d }0 y0 ]' y8 x print(one_hot.shape) # (150, 3) 8 ?8 o4 h" e7 n; e$ o/ ?' f2 S' _9 p+ \- q t3 b7 y" @ dummy = pd.get_dummies(iris.target)5 a$ a( \! A& ~2 y print(dummy.shape) # (150, 3)- s& }& V( X0 W9 u% o' I
5 \5 a+ f7 e" Q! @

缺失特征值补全

+ q( a" K. l" Q( r

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

# c; z4 R" r; c( `* Q# a9 W

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

! Q, T+ D! {. }- R
from numpy import vstack, array, nan % ^ `+ f- `* K # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据9 I3 ~/ @/ E$ d5 V5 a from sklearn.impute import SimpleImputer0 q0 k1 T: t* x8 v; h6 \ , h2 g, B" A, i3 L* q& q& n. [* P # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN ' r) ~4 ^; ~; C # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值)* T: o/ e+ q- o( R imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean") 9 l, `6 U8 r7 @( X0 a$ F: O9 ]( w" k1 M& [) C# H data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data))0 A. T5 v2 ~4 m6 s! l+ n7 T print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] 4 ?0 p" q) _- F3 Z9 ? result = imputer.fit_transform(data)+ ^' V$ ]; r- f( b. I! M. I* k print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]]+ c( ]. H+ n0 c% A
$ p% d0 g2 j8 `

数据变换

; S* S1 h7 [4 E3 X

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

6 {! a6 h9 A1 B: l. ]' k, {! z) |

基于多项式的数据变换

/ O5 ~5 y6 G# N

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

% m2 f9 g$ L2 w! u/ C- Q

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

3 g9 ]6 L0 h7 p3 n

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

2 z( A/ ?2 }. T1 t: t- k0 }- f' q/ r

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

8 ]9 ~' N1 @) m/ }( i. k
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换 . p+ |" _. F! p* G+ ?1 \- B5 a # 参数degree,默认值为2* O3 ?% z2 N3 _8 c9 G4 w" a ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data)" L1 n1 z- o" ~; } print(ploy.shape) # (150, 15)' y- F, o# F8 v0 F+ ^2 W print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]] # |; v' G( o H' o
' F/ o; q+ h7 k; A

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

6 b" [2 h/ I/ T; h

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

8 M0 y& v8 S8 C: A- l( q

基于对数函数的数据变换

, [+ L& ]9 L d" y! Z: c* i( k4 l

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

4 Z# b7 P* \: Q0 d! [8 t, f) w# p

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

9 F u3 H( h$ j) T
from numpy import log1p 6 Q. U& d8 V9 A" _. J9 Q from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer) x/ _9 I# I9 r. h8 i # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射0 `& P! e/ r2 B: X% V( ] # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换 / j0 N5 B9 c! Y6 e/ `' b1 u # 第一个参数是单变元函数 : s; g- b$ V/ `- M' v4 D$ A; l( H: ^5 B log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data) " c& H/ {: a L B0 Z( u print(log_one.shape) # (150, 4) $ X* c$ ^. X, v1 \* V print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]] Z, V" |! z/ n6 z5 U8 M
( u7 {- G; B2 c) d1 Y5 {

总结

2 K' _ l7 ?2 N v* j

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

% N! k2 G$ v3 D; W- e
! [6 W5 L0 m" L% g- y' E$ {

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化 * ]: k4 V3 b& Y' h; @% Z8 a% U2 D! Z% z- q$ {' I 3 F) s2 y3 B% X" G0 @ & h- @* N# C, g' L9 E, x , H( A. s% h. x3 Y) x3 R
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