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浅析sklearn中的数据预处理方法

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+ K D! ^6 S8 G g

简介

8 D x) ^ u# E; e9 Y$ O

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

* [7 @0 N2 g: c0 S$ U9 R. S

数据集准备

$ S2 \( w$ Z9 H3 f% d, x. C# Z

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

( ~8 S( S6 S, O2 E, _1 }8 `7 ]
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集' O) v7 i/ Z3 w8 L" i import numpy as np - t" a; D4 i- }- J" m8 U! X9 a- t1 r# t: M u iris = load_iris() # 特征矩阵# }- V( A- d0 h1 e print(iris.data.shape) # (150, 4) 6 N+ A2 I3 q$ k* e1 `/ x print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]] . N* W, ], q, h& | t print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2] 9 i2 P% @( }" w2 [2 \
{/ r( R! y- o# [; U6 |1 P

无量纲化

" Q# M& ^0 r; l/ n

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

6 U9 r9 u! _& u

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

% E% h+ ^* ~. J; v _+ q6 K

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

( |$ Z5 C( V3 a! ~

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

' u0 b e+ W" q- Q! \3 K7 |

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

6 ^$ ?0 G5 _& ?; b

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

' j- V3 {8 X2 [9 I: n" Z

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

7 e# z, q9 r6 G/ V

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

% v# x# B' [* y8 G0 e& _

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

; W# x' _9 T2 a L9 W6 I T2 n# R

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

, _9 R% o: N* ?' Z/ Y

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

0 I7 q; i6 H! v6 q6 v' q. e) C* G m

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

5 A7 U/ x1 ~# R/ L5 H
from sklearn.preprocessing import StandardScaler 1 J/ R/ c& V# n$ A: I- t5 s& m, G4 L) U( }& p # 标准化,返回值为标准化后的数据4 e8 C/ O6 c% B( | standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data) / `$ u. W6 _0 J9 y print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]] / d! v1 \% E+ G7 P# {4 m, j
% b; P* h9 y/ P, \' p4 z6 ~

归一化-区间缩放法

4 ?) }0 q6 ] g$ `

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

- w" B( n( \3 g3 o

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

0 e# m' K6 ] f8 q3 y0 c, V5 c6 ?

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

0 H" u1 z/ j2 Y- D! O2 ~! j

常见用于神经网络。

( L( k7 B, g% p1 n0 X: ~8 h% V4 u

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

6 D8 L7 N' f- Z
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据( Q0 r, A/ P; X from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler- r- ]0 _( y0 G) M3 P + j) D% |% }8 k8 e- y min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data) \& U8 q2 z4 e$ e print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]] ' C8 G0 W2 k6 r2 n B/ D
0 ]( d# ^. k' u. S

正则化(Normalization)

5 b% N$ d; m; P" i6 [% I5 ^

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

: P7 E1 s E3 ^+ m

常见用于文本分类和聚类。

& y% U" u: L7 m; }

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

9 \' o7 ~+ o; Z. G) w8 v8 O

LpL_p范数的计算公式如下所示:

( J$ z7 I I* s8 a9 O0 y

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

2 q1 z3 a7 L# V* Z; U; T$ b) x+ q

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

1 B; l4 B/ c0 O% Z5 r4 k, H- ? M

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

1 p$ r$ O# |! f+ A. u/ g8 s* i

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

+ M; i0 M. N" V0 K6 {) Y7 J3 D- J

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

0 ?$ ~, ]3 j9 B! S J/ t
from sklearn.preprocessing import Normalizer6 k3 f- u' h6 ^ u6 F: s( t( |7 X norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data): r, @* [* ^, Y" F print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667] 0 A5 ~9 @9 u/ A6 N# ^* Y
# w- d9 g V9 L+ k2 F8 n$ Y( J4 t T

参数说明:

8 I# q6 k! ?4 C9 H/ c! X! }

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

8 r* S6 i& q( |9 |) O( W& B

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

- d' Z$ V" m/ W& \& w; h& I+ a

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

; ^) p. k; a9 r- B+ U/ r! S& I9 o

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

7 }% g2 H9 y- o0 Z* a1 S6 P

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

1 v q; H* S- G' T, v8 ^
from sklearn.preprocessing import Binarizer - T' S/ [1 C) I! K( K $ m% j- F d: A: d # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据# u6 q* H" q4 Z$ ^$ {/ j binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data) c: S3 j& [4 K8 E% x2 ` print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]] % X* i7 C0 v' N) s3 ^/ y1 s4 w8 Q% z
& M/ e! O1 y3 i- K3 G' R2 Q

对定性特征独热编码

7 o! F$ s6 [! h0 \8 C

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

/ o% {$ q* L" j

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

( O0 J! m' V6 W/ a. ?4 P

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

Q8 L, N% \- t C, Z% ?- c
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据& c. Y. f- E3 B- e. W4 J. v2 j2 b from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder 2 ]9 S6 ~9 b( L+ {8 e1 J import pandas as pd1 r% A7 A0 A; ]( z! I5 g - a- P3 m- m' e5 G9 l print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1)) w& w) P: |, j& `9 f! Z- | one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1)). B3 ~! R( P. K# W5 }' A5 Z* ^ print(one_hot.shape) # (150, 3), A" U: k/ L- k# F: L" ^0 Y y) b $ y: d: C/ T& o4 a/ n4 d( @! Z dummy = pd.get_dummies(iris.target) , F# [; d- E5 O; I9 J+ w# t2 D4 G print(dummy.shape) # (150, 3)1 |) O1 T4 N: Q t/ m
5 e# Z2 I4 Y* ?" E2 w

缺失特征值补全

( @- C! h9 Q u$ I# q: Z4 K5 q

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

5 z) e: X: G5 I1 ^ a+ x

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

$ I6 ?% @" M [5 j: C% t& h% S
from numpy import vstack, array, nan1 q/ X M+ N; i' ]' v" [ # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据& R. w+ b. A& G9 s+ e% w from sklearn.impute import SimpleImputer ( Y& }' A, I; ~2 `# L) |- q2 x 1 N* ^, O* T6 y3 E. s # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN4 h- |' P! g1 G8 C* n$ g # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值). Y% k: _; @: i0 T* f! ` imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean")* ^+ C. V) [$ |- i( o; `/ N F+ j . O* P# o/ `2 o data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data)) ' p5 d% I4 m5 E print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] 5 Y6 m* q( j0 q* W; S result = imputer.fit_transform(data)) {0 m) ^6 q+ v4 U/ |: A, a print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]]* [2 \' T; Y) P! a
+ p- p# h0 Z6 R& U

数据变换

- {5 P3 `/ X; L0 e( k4 A

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

7 E% \) H1 U" K9 u" X, W2 d

基于多项式的数据变换

7 n8 w) R" c% t, ]. L& Z

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

. B. D* `" k5 l3 {& e. X" L+ P1 \. m

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

2 O6 L+ s5 p$ @- U7 d5 \

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

0 W/ u) k) d, `5 t+ R, @! c) u

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

$ P1 Y+ n$ `8 |( a
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换 ) M$ I4 ` l8 | _& h8 g7 A # 参数degree,默认值为23 w* i7 A) `3 x. \, N# T ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data)2 I5 @ e5 P* p. Z5 ~ print(ploy.shape) # (150, 15)1 ]( n/ V9 ?& i. y print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]] & h% b0 A) w- N' r
8 P: S4 ^4 u, W/ j! E4 E* @

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

k" ^) W5 Z" O$ ]4 X( {, c. B

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

- q% i' h. z! P( Z# B# I) c: [

基于对数函数的数据变换

6 M2 K: U4 e7 I

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

) [, o. K/ w: q

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

* Y% ~7 M- l7 P2 u7 V
from numpy import log1p7 _7 U @7 o( l: b( u2 ] from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer ) z- s, h9 h4 T9 h# ?# T # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射. V" y( B7 a2 B1 u4 K # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换" V- H$ L' }+ u4 i+ s # 第一个参数是单变元函数 5 b1 r: S7 G+ l9 s log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data)! A4 f2 u [0 P9 X/ K2 x print(log_one.shape) # (150, 4)0 G1 n9 }+ }1 x8 Z! I% G6 M print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]] # f, w& N" N6 Z2 Q3 W# V7 M
- |" i2 e: Q) a" X$ t

总结

, \' }; G) p$ T6 C) y

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

: e6 t' E9 Y5 h* L C5 @
: j! P, x7 w, @& Y3 {! |

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化) E! O7 s, S# n, X2 a' D8 { 8 O; t( \ O6 f9 T6 n0 T - k9 |1 \/ ^8 t" T" R$ H8 I' `% w + J# g G6 p" r5 L: m
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