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浅析sklearn中的数据预处理方法

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* [, \; _( Z* H$ g) ]2 t0 l

简介

. ~# M" O; }( D+ I: w

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

0 |' k# j) O: C7 u/ }

数据集准备

, a5 }+ t2 ~5 t" Y! |1 K

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

' w- ]- U* I6 K' b, @1 ^9 Y4 a
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集+ _! y5 O% H, {' J# T6 N9 P+ z import numpy as np9 h0 G' I" x9 `! L9 {, ]1 f % m7 Q, W; x: ]8 N) {9 r iris = load_iris() # 特征矩阵& {2 j' C+ r" q* g print(iris.data.shape) # (150, 4) , Z& _, l9 ?' T9 O print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]]9 r( J0 E V6 z, i5 V% I; `3 S print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2]5 A, L e' M6 u
$ I) K) v! ^; V; j- c

无量纲化

$ j. k3 S/ G# z$ m

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

4 ^- y6 u! n" J, f) I- y

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

0 t4 g: d0 A9 M* {/ U

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

) ^, W& Q$ N6 ~/ A

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

* Q7 v* N* z- w9 C3 T) U. m

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

- J& n; A U' f @- P

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

, m$ x8 F# T f4 |/ h, b- B

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

4 S4 k1 i7 d( N

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

% _' s8 h8 W1 H- |& F& Q" m

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

( Y, `6 F' W# ^1 N8 P1 k. h _9 n

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

* D4 j: t0 m" F5 @7 N( c

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

" n" }# y) b u6 d' ~

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

% b$ @& G5 _4 i' u- M! K
from sklearn.preprocessing import StandardScaler5 _$ Q G; F5 \ + `- @" P" n7 A # 标准化,返回值为标准化后的数据 5 w* _( w+ o L# ~6 Z1 [ standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data) # x& c4 `! D$ K$ F* M. Y5 ]! X print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]]5 F# f% K& Y. B; V3 b0 \
* V- R+ I/ d; D; Q R0 E7 J

归一化-区间缩放法

( s, X f! @- W: l% L

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

5 ^5 q9 x; r; ?

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

" \7 G+ H+ y; D1 K1 R4 D; S

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

- v- q$ w. Q2 A" G7 c

常见用于神经网络。

9 i8 k' a- H2 O& B; r

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

* L5 J1 ^- B8 K0 d4 `
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据 + C7 ]( p! V6 v, Q from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler k& C! N9 q4 q- @ . ~' J+ e9 x6 A9 P& i# p1 X% H min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data)% J1 t, `" t( X* \8 r% r7 Y print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]], ^* @4 w. [3 Q8 s
6 e- M2 K6 m2 @

正则化(Normalization)

& @: K$ M% R+ M; J

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

$ ~4 _# w: |* g: Q1 y6 V7 `( ~

常见用于文本分类和聚类。

# o8 G0 s+ J: y j: y- |+ I; @

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

( x$ o2 G; c# C" p1 K# T0 k2 F! C

LpL_p范数的计算公式如下所示:

! N8 [; \8 y4 q% `; l% v! D! O

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

; H" X8 k# A* R, B7 D/ G/ I

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

% m4 j2 |( X. g: l* I) R4 W+ G

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

$ b$ ?6 m4 o% d w6 z2 m3 M5 {

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

/ ~* N$ Q) m# i: Y$ w

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

8 l; W5 X/ N$ l( }$ ]4 i: ~$ q$ t! C
from sklearn.preprocessing import Normalizer) X5 r1 x, l8 @* X9 {& ]$ j 2 q/ E) D4 n; F5 t* i% {0 C norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data); M0 B4 R9 C& ^) o( C print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]: j: }6 i& d+ |
9 w4 p. @- e8 \- A

参数说明:

, P* w! y# |" z

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

* e4 F3 o' Y7 ~3 w

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

$ x; y2 H- `; o

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

! `" r: B, B' T# ~

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

* |- A. e, @% t5 E$ z/ _" x$ O& r" `

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

" _$ V5 O- v! R0 g' b
from sklearn.preprocessing import Binarizer, q2 P# S# p3 d N- M: [; ~0 P# W- q* Y # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据 # C+ x& r1 A$ q0 \) K" F binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data)3 z$ J8 ~5 Z. P% ]7 b print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]] # c# V' z6 W) ~
- J1 x" C- I4 \+ L# j' Z) e8 |* z4 }! _, `

对定性特征独热编码

3 [- W# g& w' C, I" A8 b) E$ [4 v

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

" Q! I3 r3 c; E; p" X k

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

2 X, u4 J+ i, x, U5 |1 a: S

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

! a7 w' @* p) r- n) C
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据0 O( v* @1 ?( i7 u from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder6 h8 s/ z1 M8 Q+ F* Z$ D import pandas as pd ' m; Z" ^% D7 D9 c0 G $ ]/ } {1 C& [% ]; O print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1) 1 l& b+ b6 H: e- j$ H/ M) |& L# q one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1))& \ ^1 A' j2 I* s% | print(one_hot.shape) # (150, 3) 6 F$ l i7 G. c8 x1 D5 L& V3 A3 `4 N& q. t dummy = pd.get_dummies(iris.target) # t: u& V% w: d+ U: F6 u5 N* y' U print(dummy.shape) # (150, 3)( E& O' M/ `+ M7 _: S) R! E9 p, K
2 {+ N' O$ `+ [

缺失特征值补全

+ K& N' e+ v3 _ d/ h5 H

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

& a# G! k# g4 K

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

4 [3 V9 k. W N9 q+ z" x, t
from numpy import vstack, array, nan) E; d: B. S8 i, ]- Z9 b # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据 R- S+ F# }: G1 d9 X8 z from sklearn.impute import SimpleImputer) T# x. Y4 R, k% L4 Y' m; r / y) q. M% v! g r- y/ o # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN& C# I; z! T' N$ m' Z2 D5 B # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值)/ d7 s- m0 X) ^% ^( J imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean") ~( k4 Y1 i4 b/ q9 h" b$ I$ P; x3 v2 R ; p' |. P9 T( H; e2 b data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data)) 9 x" _+ Q- t4 y+ {% P& N& w0 \ print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] & C& N9 P( x, o ~/ A% H# g% W result = imputer.fit_transform(data) : a2 j) z" t9 [. N! l print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]]; B0 z0 X2 o# K) r5 A% N. c
* a7 e0 M1 j1 b8 m1 q

数据变换

8 f. i0 T# K7 a

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

8 y5 Y( M) H7 C+ I

基于多项式的数据变换

- N1 H# J7 E( `9 Z7 o4 g% \! R+ u

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

' K' m8 I: _/ P) N/ o

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

, J; s& A# Z. ]

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

) }2 I& j# X* k9 Y% K- j e U* O

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

2 u2 {! L7 A6 E7 ]+ Q, @! W6 P$ @8 J
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换 % {: s6 T* g# K; o6 R0 ]) M$ l$ D # 参数degree,默认值为2! u& z7 {8 {' h ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data) , y: p4 W: v/ l& A6 Z print(ploy.shape) # (150, 15)2 z$ I w9 F: F5 l print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]] ) K7 u6 r- K' {6 g v/ N
/ @; a) H3 ?$ ]( U+ i

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

# l9 |! [, i: u$ o

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

" D: s+ o) d- n" g

基于对数函数的数据变换

% L% S9 A; v- [1 c; T; k

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

" T# ]6 _8 o& O

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

& j) o; [2 n# x. T( N
from numpy import log1p 6 @8 ?! P1 {7 h from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer 5 ^) N4 w. n) [, m1 f3 P # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射0 R" ]- v* X4 K9 M4 m # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换% i! V. y' v8 ]. K% S+ c # 第一个参数是单变元函数: G# t3 Y9 g5 m2 J* m. \! C log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data) * H# x- J, W6 @7 J print(log_one.shape) # (150, 4)4 w% r3 Y5 r6 J' N8 d. \ print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]]- T" k, K$ Y i% h' f+ e: {+ Y
$ H ~9 c6 T+ I! |

总结

% \4 c% o1 m, X+ O4 w

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

* T. l+ W$ P; |2 c- p: a4 m
" q& w; {- N8 h

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化 B$ [. \% n% u9 r% _- j: I" k) w7 c9 a' Q2 w! I/ u | , N! a7 M$ n+ T# f* G; r 1 }1 b% ^% D$ E7 k: E7 w/ i! m2 G1 u2 ^1 `; a& {, f2 N
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